Расовая дифференциация фитопатогенной бактерии Xanthomonas campestris в зависимости от состава эффекторов третьей секреторной системы патогена

Руководитель проекта

Игнатов Александр Николаевич

Игнатов Александр Николаевич

ведущий научный сотрудник, главный научный сотрудник, профессор

Общая информация

Капустные растения (сем. Brassicaceae) являются ценным пищевым и промышленным ресурсом. Они используются как важные овощные (1-2 место в России), фуражные и технические культуры, занимая третье место в мировом производстве растительного масла после сои и масличной пальмы (Agricultural Statistics 2019). Считается, что в среднем бактериозы снижают урожай на 5-10%, и основная проблема состоит в отсутствии эффективных химических бактерицидов для борьбы с ними, в быстром возникновении вирулентности к расово-специфичным типам устойчивости растений. Данный проект подразумевает комплексное рассмотрение проблемы защиты культурных растений семейства Brassicaceae от сосудистого бактериоза.

Переход к высокопродуктивному и экологически чистому агрохозяйству, разработка и внедрение систем рационального применения средств защиты сельскохозяйственных растений требует расширения ассортимента устойчивых сортов растений и биологических методов и средств борьбы с болезнями. Сосудистый бактериоз капусты, вызываемый бактерией X. campestris, является наиболее вредоносным бактериальным заболеванием капустных культур, и сам патоген является модельным представителем рода Xanthomonas, поражающим более 400 видов культурных растений. Данное исследование направлено на комплексное изучение генетики патогена, поражаемого растения и внешних факторов (климатические условия), проводимое на обширной коллекции изолятов патогена, собранных в течении почти 30 лет, и растений коллекции рода Brassica.

Цели проекта

    Сравнить изоляты возбудителя сосудистого бактериоза (Xanthomonas campestris), циркулирующие в России и в мире (по данным анализа исторической коллекции, собранной с 1994 г.), секвенировать геномы выбранных штаммов, оценить эффективность и усовершенствовать методы диагностики возбудителя сосудистого бактериоза. 

    По мере накопления генетических данных, проанализировать последовательности праймеров и зондов, применяемых в коммерческих и описанных в литературе методах ПЦР определения патогена, сделать выводы о наилучшей комбинации методов молекулярной диагностики для наиболее точного определения патогенов, а на основе ранее не изученных консервативных участков геномов бактерий предложить новые зонды и праймеры, при помощи которых будут охарактеризованы новые расы X. campestris, идентифицированы гены-кандидаты, связанные с расами и генетическими/ экологическими типами патогена.

    Будет проведена оценка связи фенотипа устойчивых и восприимчивых образцов растений с молекулярными маркерами, ранее ассоциированными с резистентностью.

Продолжая использовать сайт ati.rudn.ru вы соглашаетесь на использование cookies. Более подробная информация на странице Политика конфиденциальности